Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FMODQ06828 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FMODQ06828 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FMODQ06828 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FMODQ06828 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FMODQ06828 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FMODQ06828 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FMODQ06828 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FMODQ06828 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms