Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF11Q05519 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms