Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD164Q04900 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD164Q04900 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD164Q04900 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD164Q04900 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD164Q04900 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD164Q04900 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD164Q04900 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms