Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms