Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL23P62829 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL23P62829 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL23P62829 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL23P62829 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms