Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPEP62304 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms