Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5BP61020 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms