Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms