Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A1P52655 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A1P52655 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A1P52655 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A1P52655 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2A1P52655 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms