Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK8P49336 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK8P49336 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK8P49336 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK8P49336 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK8P49336 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK8P49336 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK8P49336 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK8P49336 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK8P49336 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK8P49336 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK8P49336 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms