Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEA1P43355 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms