Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms