Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA4P41247 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA4P41247 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms