Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP62P37198 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP62P37198 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms