Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKAP35790 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKAP35790 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKAP35790 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHKAP35790 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHKAP35790 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHKAP35790 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms