Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC2P35250 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC2P35250 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC2P35250 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC2P35250 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC2P35250 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC2P35250 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC2P35250 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC2P35250 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC2P35250 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC2P35250 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC2P35250 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC2P35250 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC2P35250 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms