Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PCGF2P35227 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms