Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms