Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms