Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPLP06858 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPLP06858 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPLP06858 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPLP06858 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms