Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FGAP02671 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGAP02671 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGAP02671 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGAP02671 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FGAP02671 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGAP02671 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGAP02671 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGAP02671 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGAP02671 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms