Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA2P01563 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA2P01563 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms