Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA1P01562 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA1P01562 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms