Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRUB2O95900 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms