Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN15O75808 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms