Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX6O43752 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX6O43752 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STX6O43752 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX6O43752 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX6O43752 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX6O43752 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms