Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD28O15084 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms