Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E1Z4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E1Z4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E1Z4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E1Z4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E1Z4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
B4E1Z4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms