Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYSRT1A8MQ03 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms