Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms