Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLCA3PQ9Y6N3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCA3PQ9Y6N3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCA3PQ9Y6N3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCA3PQ9Y6N3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA3PQ9Y6N3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms