Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms