Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP2Q9Y5Y2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUBP2Q9Y5Y2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUBP2Q9Y5Y2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms