Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPB11Q9Y547 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSPB11Q9Y547 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB11Q9Y547 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPB11Q9Y547 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB11Q9Y547 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB11Q9Y547 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms