Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMACHCQ9Y4U1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMACHCQ9Y4U1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMACHCQ9Y4U1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMACHCQ9Y4U1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms