Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL3Q9Y4R7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL3Q9Y4R7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTLL3Q9Y4R7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL3Q9Y4R7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL3Q9Y4R7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms