Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Q9Y3F1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Q9Y3F1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Q9Y3F1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Q9Y3F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Q9Y3F1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9Y3F1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9Y3F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Q9Y3F1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Q9Y3F1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Q9Y3F1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9Y3F1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9Y3F1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9Y3F1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms