Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC9A8Q9Y2E8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A8Q9Y2E8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A8Q9Y2E8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A8Q9Y2E8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A8Q9Y2E8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A8Q9Y2E8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A8Q9Y2E8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A8Q9Y2E8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A8Q9Y2E8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A8Q9Y2E8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A8Q9Y2E8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A8Q9Y2E8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms