Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HDAC5Q9UQL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HDAC5Q9UQL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HDAC5Q9UQL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HDAC5Q9UQL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HDAC5Q9UQL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
HDAC5Q9UQL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HDAC5Q9UQL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms