Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQK1

PPP1R3C, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3CQ9UQK1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3CQ9UQK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3CQ9UQK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3CQ9UQK1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R3CQ9UQK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms