Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SHOC2Q9UQ13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHOC2Q9UQ13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHOC2Q9UQ13 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHOC2Q9UQ13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHOC2Q9UQ13 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHOC2Q9UQ13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHOC2Q9UQ13 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHOC2Q9UQ13 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHOC2Q9UQ13 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHOC2Q9UQ13 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHOC2Q9UQ13 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHOC2Q9UQ13 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHOC2Q9UQ13 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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