Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPK3Q9UPE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPK3Q9UPE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK3Q9UPE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPK3Q9UPE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK3Q9UPE1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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