Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFU1Q9UMS0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFU1Q9UMS0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFU1Q9UMS0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFU1Q9UMS0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFU1Q9UMS0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFU1Q9UMS0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFU1Q9UMS0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFU1Q9UMS0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NFU1Q9UMS0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFU1Q9UMS0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms