Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CIZ1Q9ULV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CIZ1Q9ULV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CIZ1Q9ULV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CIZ1Q9ULV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CIZ1Q9ULV3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CIZ1Q9ULV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CIZ1Q9ULV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CIZ1Q9ULV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CIZ1Q9ULV3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CIZ1Q9ULV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CIZ1Q9ULV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CIZ1Q9ULV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CIZ1Q9ULV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CIZ1Q9ULV3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CIZ1Q9ULV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms