Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKM9

RALY, RNA-binding protein Raly, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALYQ9UKM9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALYQ9UKM9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALYQ9UKM9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALYQ9UKM9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RALYQ9UKM9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALYQ9UKM9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RALYQ9UKM9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RALYQ9UKM9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms