Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCND3Q9UK17 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND3Q9UK17 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND3Q9UK17 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCND3Q9UK17 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCND3Q9UK17 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND3Q9UK17 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms