Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCTN4Q9UJW0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCTN4Q9UJW0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCTN4Q9UJW0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCTN4Q9UJW0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCTN4Q9UJW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCTN4Q9UJW0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms