Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMS3Q9UJD0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIMS3Q9UJD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMS3Q9UJD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMS3Q9UJD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMS3Q9UJD0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMS3Q9UJD0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMS3Q9UJD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms