Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCMT1Q9UIC8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCMT1Q9UIC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCMT1Q9UIC8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LCMT1Q9UIC8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LCMT1Q9UIC8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCMT1Q9UIC8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms