Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPN4Q9UHM6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN4Q9UHM6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN4Q9UHM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN4Q9UHM6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms